O Órgão de Gestão é o órgão colegial responsável pela definição das funções, competências e organização dos serviços que integram a CAAJ, assim como pela emissão de normas a observar no desenvolvimento das atividades a seu cargo, e tudo o mais que se torne necessário para o adequado funcionamento da CAAJ.
É composto por um presidente e dois vogais, nomeados por resolução do Conselho de Ministros, por um prazo de cinco anos.
Presidente
Renato Jorge dos Santos Carvalho Gonçalves
(Resolução do Conselho de Ministros n.º 111/2024)
Vogal
Emanuel de Castro Lameiras Vieira
(Resolução do Conselho de Ministros n.º 111/2024)